MicroRNA w przewlekłej białaczce limfatycznej

Calin i in. (Wydanie 27 października) raport na temat mutacji genomowych w obrębie loci mikroRNA u pacjentów z przewlekłą białaczką limfocytową (CLL). Uważamy, że częstotliwość, z jaką można wykryć takie mutacje, nie została dokładnie oszacowana, a niektóre dane komórkowe były nieprawidłowe. Spośród 69 próbek komórek CLL, w których utracono jedną kopię chromosomu 13q, nie zidentyfikowano mutacji w obrębie segmentu 581-bp obejmującego gen miR-15a-16-1. Uważamy również za bardzo zaskakujące, że pojedyncze podstawienie poza spirem pri-miR-16-1 zniosło ekspresję zarówno miR-15a, jak i miR-16-1, jak przedstawiono na rysunku 2E oryginalnego artykułu. Rysunek 2E jest niejednoznaczny i błędnie oznaczony. Wydaje się, że miR-15a (błędnie oznaczony jako U6, który jest 100 nukleotydem małym jądrowym RNA) jest obecny we wszystkich próbkach i że miR-16-1 nie występuje nawet w komórkach kontrolnych 293. MiR-15a stanowi około 5 procent, a miR-16-1 około 10 procent całkowitej zawartości mikroRNA w komórkach 293. Pozostaje niewyjaśnione, dlaczego wykryto miR-15a w lewej części Figury 2E, ale miR-16-1 nie wykryto w prawej części, pokazując kontrolne ludzkie zarodkowe komórki nerki 293.
Arndt Borkhardt, MD
Uta Fuchs, Ph.D.
Ludwig-Maximilians-Universität München, 80337 Monachium, Niemcy
arndt. [email protected] uni-muenchen.de
Tom Tuschl, Ph.D.
Rockefeller University, New York, NY 10021
Odniesienie1. Calin GA, Ferracin M, Cimmino A, i in. Sygnatura mikroRNA powiązana z rokowaniem i progresją w przewlekłej białaczce limfatycznej. N Engl J Med 2005; 353: 1793-1801
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
Calin i in. stwierdzili znaczący związek pomiędzy sygnaturą ekspresji mikroRNA i ekspresją ZAP-70, mutacyjnym stanem genu regionu zmiennego łańcucha ciężkiego immunoglobuliny (IgVH) i czasem do początkowego leczenia u pacjentów z CLL. Sugerują, że ekspresja mikroRNA może być uwzględniona jako marker prognostyczny w CLL. Ta propozycja jest przedwczesna, ponieważ sygnatura mikroRNA wydaje się być surogatem dla wysokiej ekspresji ZAP-70 i niezmutowanej IgVH, o których wiadomo, że są markerem złego rokowania u pacjentów z CLL.1-3. Przeprowadzono analizę wieloczynnikową, aby wykazać, że microRNA jest niezależnym czynnikiem prognostycznym. Ponadto, nie jest jasne, czy lista genów mikroRNA, które przewidują czas do leczenia, całkowicie pokrywa się z mikroRNA, które są związane z ekspresją ZAP-70 i stanem mutacji IgVH (tylko pięć jest takich samych), zwłaszcza, że chip stosowany do wykrywania mikroRNA może rozróżniać podobne izoformy mikroRNA. Ostatecznie nie jest jasne, czy zestaw dziewięciu mikroRNA, które przewidują progresję, został zwalidowany w niezależnym zestawie 50 pacjentów z CLL.
Wee J. Chng, MD
National University Hospital, Singapore 119074
[email protected] com.sg
3 Referencje1. Rassenti LZ, Huynh L, Toy TL, i in. ZAP-70 w porównaniu ze znaczeniem mutacji w genie ciężkiego łańcucha immunoglobuliny jako prognostykiem postępu choroby w przewlekłej białaczce limfatycznej. N Engl J Med 2004; 351: 893-901
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Crespo M, Bosch F, Villamor N i in Ekspresja ZAP-70 jako substytut mutacji regionu zmiennego immunoglobulin w przewlekłej białaczce limfatycznej. N Engl J Med 2003; 348: 1764-1775
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
3. Hamblin TJ, Davis Z, Gardiner A, DG Osier, Stevenson FK. Niezmutowane geny Ig V (H) są związane z bardziej agresywną postacią przewlekłej białaczki limfatycznej. Blood 1999; 94: 1848-1854
Web of Science MedlineGoogle Scholar
Odpowiedź
Autorzy odpowiadają: W naszym artykule opisaliśmy sekwencje 42 genów mikroRNA u 75 pacjentów z CLL i odkryliśmy mutacje w 5 z 42 genów u 11 pacjentów. Z tego powodu jesteśmy zaskoczeni, że Borkhardt et al. zakwestionował nasze szacunki na podstawie braku znalezienia mutacji w transkrypcie miR-15a-miR-16-1 w 69 przypadkach CLL. To Borkhardt et al. nie stwierdziliśmy, że ta rzadka mutacja linii zarodkowej, którą zidentyfikowaliśmy tylko u 2 z 75 pacjentów, nie jest nieoczekiwana. Co więcej, częstotliwość mutacji linii zarodkowych może się różnić w różnych populacjach, i jeden z naszych pacjentów z mutacją linii zarodkowej w miR-15a-miR-16-1 miał rodzinną CLL. Zmniejszenie ekspresji genu indukowane przez tę mutację powtórzono w dwóch niezależnych eksperymentach i ilościowym oznaczeniem odwrotnej transkryptazy-reakcji łańcuchowej polimerazy. Mechanizm odpowiedzialny za ten efekt pozostaje do zidentyfikowania. Borkhardt i in. są poprawne, że rysunek 2E jest błędnie oznaczony. Nagłówki zostały odwrócone; lewa część powinna brzmieć miR-16-1 , a prawa część powinna być oznaczona miR-15a .
W przeciwieństwie do twierdzenia Chng, nasza rozszerzona sygnatura, związana z ekspresją ZAP-70 (przedstawioną w Dodatkowym dodatku do artykułu) i złożoną z 19 mikroRNA, obejmuje wszystkie 9 mikroRNA, które przewidują czas do leczenia (a nie 5, jak stwierdzono przez Chng). Nie stwierdziliśmy, że ekspresja mikroRNA powinna zastępować ekspresję ZAP-70 i status mutacji IgVH jako markera prognostycznego w przypadkach CLL, ale raczej, że jest to nowy marker prognostyczny. Nie określono jeszcze, czy jest to niezależny czynnik prognostyczny. Ostatecznie, ponieważ nie mieliśmy danych o przeżyciu dla zestawu testowego 50 próbek CLL, ograniczyliśmy nasze analizy do przypadków z danymi na temat ZAP-70.
George A. Calin, MD, Ph.D.
Amelia Cimmino, MD, Ph.D.
Carlo M. Croce, MD
Ohio State University, Columbus, OH 43210
carlo. [email protected] edu
Odniesienie1. Liede A, Karlan BY, Narod SA. Ryzyko wystąpienia raka u męskich nosicieli mutacji linii płciowej w BRCA1 lub BRCA2: przegląd piśmiennictwa. J Clin Oncol 2004; 22: 735-742
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
(13)
[patrz też: pierwsza pomoc algorytm, fala uderzeniowa w rehabilitacji, czasopismo medycyna pracy ]
[patrz też: przychodnia 11 listopada, rosucard, dyżur aptek malbork ]